Bulk 转录组分析
从 FASTQ 到差异分析、富集、WGCNA、可变剪切的完整 Bulk RNA-seq 通路
Bulk RNA-seq · QC + 比对
2 天
FASTQ → 表达矩阵:质控、去 adapter、HISAT2/STAR 比对、featureCounts 定量
Bulk RNA-seq · 差异表达分析
1 天
DESeq2 / edgeR 差异分析 + 火山图 + 热图 + PCA
Bulk RNA-seq · GSEA 通路分析
1 天
Hallmark / KEGG / Reactome 通路 GSEA,含富集得分图
Bulk RNA-seq · ceRNA / lncRNA 调控网络
1 天
mRNA-miRNA-lncRNA 三元网络构建与可视化
单细胞转录组分析
Seurat 标准流程到拟时序、细胞通讯、转录因子调控的单细胞分析
单细胞 · SCENIC 转录因子调控网络
3 天
pySCENIC 流程:regulon 识别 + AUCell 评分
孟德尔随机化(MR)
基于 GWAS summary 的因果推断:两样本 MR、多变量、共定位、中介分析
WES / WGS 变异分析
全外/全基因组测序:种系变异、肿瘤体细胞突变、CNV、罕见病筛选
表观组学
染色质开放性、组蛋白修饰、DNA 甲基化分析
微生物组
16S 多样性分析、宏基因组功能注释
生存分析 / 数据库挖掘
TCGA / GEO 公共数据库挖掘:生存分析、免疫浸润、Cox 建模
多组学 / 空间组学
多组学整合、空间转录组等非标需求(面议)
其他服务
图表美化、SCI 论文润色等通用支持