生信分析工作室

Bulk 转录组分析

从 FASTQ 到差异分析、富集、WGCNA、可变剪切的完整 Bulk RNA-seq 通路

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Bulk RNA-seq · QC + 比对
2 天

FASTQ → 表达矩阵:质控、去 adapter、HISAT2/STAR 比对、featureCounts 定量

起价¥300
FastQC 多样本报告
比对统计 (MultiQC)
gene counts CSV
+1
Bulk RNA-seq · 差异表达分析
1 天

DESeq2 / edgeR 差异分析 + 火山图 + 热图 + PCA

起价¥200
差异基因列表 (CSV)
火山图 PDF/SVG
热图
+2
Bulk RNA-seq · GO / KEGG 富集
1 天

clusterProfiler 富集 + 通路气泡图 / 条形图

起价¥200
GO 富集表
KEGG 富集表
气泡图
+1
Bulk RNA-seq · GSEA 通路分析
1 天

Hallmark / KEGG / Reactome 通路 GSEA,含富集得分图

起价¥200
GSEA 结果表
富集得分图
leading edge 基因列表
Bulk RNA-seq · WGCNA 共表达网络
1 天

模块识别 + 性状关联 + Hub 基因挖掘

起价¥300
模块色块图
模块-性状关联热图
Hub 基因列表
+1
Bulk RNA-seq · ceRNA / lncRNA 调控网络
1 天

mRNA-miRNA-lncRNA 三元网络构建与可视化

起价¥500
ceRNA 网络 (Cytoscape 文件)
调控边表
关键节点 Hub 基因
+1
Bulk RNA-seq · 可变剪切分析
1 天

rMATS 五类剪切事件检测 + Sashimi 图

起价¥500
rMATS 差异剪切表
Sashimi 图
剪切事件分类统计

单细胞转录组分析

Seurat 标准流程到拟时序、细胞通讯、转录因子调控的单细胞分析

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单细胞 · 预处理 + 聚类
2 天

Seurat 标准流程:QC、归一化、PCA、UMAP/tSNE、聚类

起价¥300
UMAP / tSNE 图
聚类标记基因表
QC 报告
+1
单细胞 · 细胞类型注释
1 天

SingleR / CellMarker / 手动注释三选一

起价¥200
注释后 UMAP
细胞类型 marker 表
注释依据说明
单细胞 · 拟时序分析
1 天

Monocle3 / Slingshot 轨迹推断 + 动态基因

起价¥300
Pseudotime UMAP
分支基因列表
轨迹热图
单细胞 · 细胞通讯分析
1 天

CellChat 配体-受体互作 + 通路富集

起价¥300
通讯强度热图
配体-受体弦图
Top 通路气泡图
单细胞 · SCENIC 转录因子调控网络
3 天

pySCENIC 流程:regulon 识别 + AUCell 评分

起价¥800
Regulon 活性热图
细胞特异 TF 列表
Regulon 网络
单细胞 · Marker 基因 + 富集
1 天

cluster marker FindAllMarkers + 功能富集

起价¥200
Marker 基因表
富集结果表
Top marker 小提琴图 / 热图

孟德尔随机化(MR)

基于 GWAS summary 的因果推断:两样本 MR、多变量、共定位、中介分析

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MR · 两样本孟德尔随机化
2 天

TwoSampleMR + IVW / MR-Egger / WM 综合判断

起价¥500
MR 主结果表
森林图
散点图
+2
MR · 多变量 MR / MR-PRESSO
2 天

MVMR 控制混杂 + MR-PRESSO 检测离群 IV

起价¥300
MVMR 结果表
MR-PRESSO 报告
离群 IV 列表
MR · 中介 / 双向 MR
1 天

识别中介通路 + 反向因果检验

起价¥500
中介效应分解表
双向 MR 结果
通路示意图
MR · 共定位分析(coloc)
1 天

coloc.abf 验证暴露与结局共享因果变异

起价¥500
coloc PP 结果表
区域 locus 图
共定位 SNP 列表

WES / WGS 变异分析

全外/全基因组测序:种系变异、肿瘤体细胞突变、CNV、罕见病筛选

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WES · 变异检测 + 注释
2 天

GATK 流程:FASTQ → VCF → ANNOVAR / VEP 注释

起价¥600
原始 VCF
注释 VCF
变异统计报告
+1
WES · 拷贝数变异 (CNV) 分析
1 天

CNVkit / GATK gCNV 检测全外 CNV

起价¥400
CNV 区段表
全基因组 CNV 图
基因水平 CN 表
WES · 罕见病变异筛选
5 天

Trio / 单样本罕见病候选变异筛选 + ACMG 评级

起价¥800
候选变异表 (含 ACMG 分级)
HPO 关联报告
解读说明
WES · 肿瘤体细胞突变
5 天

Mutect2 / Strelka 配对/非配对体细胞突变检测

起价¥1,000
体细胞 VCF
突变图谱 (waterfall)
TMB 报告
+1

表观组学

染色质开放性、组蛋白修饰、DNA 甲基化分析

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ChIP-seq / CUT&RUN 分析
1 天

MACS2 peak calling + 注释 + motif

起价¥500
Peak BED 文件
注释结果
Motif 分析
+1
ATAC-seq 开放染色质分析
1 天

可及性峰检测 + footprint + 差异峰

起价¥500
可及性 peaks
Footprint 分析
差异峰表
+1
DNA 甲基化分析
2 天

RRBS / WGBS / 450K / EPIC 全流程

起价¥600
β 值矩阵
DMP 表
DMR 表
+1

微生物组

16S 多样性分析、宏基因组功能注释

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16S rRNA 多样性 + 群落
2 天

QIIME2 / DADA2 流程:α / β 多样性 + LEfSe

起价¥800
ASV 表 + 分类
α / β 多样性图
LEfSe 差异物种
+1
宏基因组 shotgun(物种 + 功能)
5 天

Kraken2 / MetaPhlAn 物种 + HUMAnN 功能

起价¥900
物种丰度表
功能丰度表
差异分析
+1

生存分析 / 数据库挖掘

TCGA / GEO 公共数据库挖掘:生存分析、免疫浸润、Cox 建模

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TCGA / GEO 生存分析
1 天

基因表达-临床预后 KM 曲线 + log-rank

起价¥300
KM 曲线 PDF/SVG
log-rank 检验结果
风险表
预后建模(Cox + nomogram)
1 天

单/多因素 Cox + nomogram + DCA / ROC

起价¥500
单/多因素 Cox 表
Nomogram
校准曲线 / DCA / ROC
免疫浸润分析
1 天

CIBERSORT / xCell / ssGSEA 多算法

起价¥400
免疫细胞比例表
组间差异箱线图
相关性热图

多组学 / 空间组学

多组学整合、空间转录组等非标需求(面议)

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多组学整合分析(面议)
按需

mRNA + miRNA + 甲基化 / 蛋白组等多源整合

起价¥10
按需定义
空间转录组分析(面议)
按需

10x Visium / Stereo-seq 空间表达模式与去卷积

起价¥10
按需定义

其他服务

图表美化、SCI 论文润色等通用支持

图表美化 / 重绘
2 天

投稿级矢量图,符合期刊规范

起价¥10
PDF 矢量图
SVG 源文件
配色说明
SCI 论文语言润色
3 天

母语级润色 + 学术语言规范化

起价¥80
润色后全文 (Track Changes)
修改说明