生信分析工作室

案例

以下为脱敏后的真实分析案例,配套图表与关键步骤代码均已开放

TCGA-LUAD 多组学预后建模实战(下)
TCGA
肺腺癌
WGCNA
ssGSEA

TCGA-LUAD 多组学预后建模实战(下)

WGCNA · 免疫微环境 · Hallmark 通路 · 分子亚型 · 模型验证 · miRNA 网络 · 突变景观

18 分钟
TCGA-LUAD 多组学预后建模实战(上)
TCGA
肺腺癌
LASSO-Cox
生存分析

TCGA-LUAD 多组学预后建模实战(上)

从原始矩阵到 LASSO 风险评分 · 临床关联 · 通路富集

16 分钟
TCGA 卵巢癌多组学实战(下)
TCGA
卵巢癌
ESTIMATE
WGCNA

TCGA 卵巢癌多组学实战(下)

免疫浸润 · WGCNA · miRNA-mRNA · LASSO-Cox 预后模型

15 分钟
TCGA 卵巢癌多组学实战(上)
TCGA
卵巢癌
分子亚型
limma

TCGA 卵巢癌多组学实战(上)

从分子亚型出发:差异基因、共识聚类、通路富集

12 分钟
TCGA-SARC 软组织肉瘤多组学实战(下)
TCGA
软组织肉瘤
LASSO-Cox
WGCNA

TCGA-SARC 软组织肉瘤多组学实战(下)

LASSO-Cox 预后模型、共识聚类、免疫浸润、WGCNA 与 miRNA-mRNA 网络

15 分钟
TCGA-SARC 软组织肉瘤多组学实战(上)
TCGA
软组织肉瘤
生存分析
limma

TCGA-SARC 软组织肉瘤多组学实战(上)

从 271 例临床数据到 6 大亚型差异通路,一份能直接交付的 R 流程

14 分钟
TCGA-COAD 结肠癌转录组实战(下)
TCGA-COAD
免疫浸润
WGCNA
LASSO-Cox

TCGA-COAD 结肠癌转录组实战(下)

免疫微环境、WGCNA 共表达、LASSO-Cox 预后模型、临床联动

15 分钟
TCGA-COAD 结肠癌转录组实战(上)
TCGA-COAD
结肠癌
DEG
分子分型

TCGA-COAD 结肠癌转录组实战(上)

从原始矩阵到差异基因、生存、分子分型与功能富集的一站式 R 流程

13 分钟
TCGA-LIHC 肝癌转录组实战(下)
TCGA-LIHC
列线图
免疫微环境
分子亚型

TCGA-LIHC 肝癌转录组实战(下)

从风险评分,到列线图 / 免疫微环境 / 分子亚型 / 治疗响应

16 分钟
TCGA-LIHC 肝癌转录组实战(上)
TCGA-LIHC
肝癌
DEG/富集
生存分析

TCGA-LIHC 肝癌转录组实战(上)

从 423 例 RNA-seq,到 13 基因 LASSO-Cox 风险模型

14 分钟
GSE56815 单核细胞转录组实战(下)
WGCNA
免疫浸润
LASSO/RF/SVM-RFE
biomarker

GSE56815 单核细胞转录组实战(下)

WGCNA 共表达、免疫信号打分、机器学习筛 biomarker

14 分钟
GSE56815 单核细胞转录组实战(上)
Bulk RNA-seq
GEO
limma
GO/GSEA

GSE56815 单核细胞转录组实战(上)

从 GEO 矩阵到差异通路,一份能交付的 R 流程

12 分钟

有类似需求?

标准流程可直接下单;非标需求欢迎发起咨询,1 个工作日内给报价